Op het moment dat er een significante hoeveelheid van het gewenste biotechnologische product is verkregen, dient het nog op een verantwoorde manier gezuiverd te worden. Cellen en microorganismen produceren naast het gewenste product ook nog andere verbindingen die zich ook in het reactormengsel bevinden. De cellen of microorganismen dienen ook verwijderd te worden. Dit profiel is dan ook gericht op de opwerking en zuivering van het product. Hierbij komen, zoals vaak in de biotechnologie, weer veel vakgebieden bij elkaar. Naast zuivering door middel van (bio)chemische toepassingen, zijn er ook diverse technische hulpmiddelen die veel meer een fysische benadering van de zuivering mogelijk maken.
periode 1

PRE-21306 bioreactor design
PCC-30803 / ORC-31303 general practical experience periode 2

SCO-20306 signals and system modeling
ORC-30806 structure and reactivity periode 3
MAT-20804 applied partial differential equations

PRE-31306 transfer processes 1
periode 5

PRE-60312 bioprocess design
Het tweede jaar zal voornamelijk bestaan uit een stage (internship) en een afstudeervak (major thesis).