Heden ten dage is er bijzondere aandacht voor (de zorg voor) het milieu in het kader van productieprocessen. Ook in dit, relatief jonge, aandachtsveld, speelt de biotechnologie een belangrijke rol. Om een praktisch voorbeeld te noemen: de manier waarop afvalwater gezuiverd wordt, kan zowel vanuit een bioprocestechnologisch, als vanuit milieukundig opzicht benaderd worden, waarbij gestreefd kan worden naar de meest optimale en haalbare mogelijkheden. Grootschalige bioprocestechnologische installaties en de milieuspecifieke technieke die hierbij betrokken kunnen worden komen in dit profiel naar voren. Ook het ontwikkelen van nieuwe typen reactoren is een belangrijk onderdeel in deze benadering. Innovatie is een belangrijk en onmisbaar element in dit profiel.
periode 1

PRE-21306 bioreactor design
MIB-31306 microbial ecology periode 2

SCO-20306 signals and system modeling
ORC-30806 structure and reactivity periode 3
SCO-31306 system and control theory

PRE-31306 transfer processes 1
periode 5

PRE-60312 bioprocess design
Het tweede jaar zal voornamelijk bestaan uit een stage (internship) en een afstudeervak (major thesis).