Biotechnologie.net :: retrotranslatie

Hoe kan je bij een mutatie van eiwit niveau terug rekenen naar DNA niveau?

Een pasgeboren dier heeft afwijkingen aan het DNA van de darmkanalen. Hierdoor wordt een niet werkend enzym amylase aangemaakt: in een stuk vande eiwitketen komen een aantal aminozuren niet in de goede volgorde voor. Normaalgesproken moet de aminozuurvolgorde er als volgt uitzien: tryptofaan (Trp) - cysteine (Cys) - isoleucine (Ile). Bij het niet werkend amylase is de volgorde van aminozuren op dit stuk van de eiwitketen veranderd. Hoe ziet het stukje DNA(n-basen noteren) eruit van een amylase dat wel werkt? In verschillende leerboeken (genetica, moleculaire biologie oid) kan je tabellen (of grafieken) vinden, die aangeven welk triplet - codon voor welk aminozuur codeert. Dit moet je opzoeken. Dan kan je kijken welk codon (soms meer dan een) voor welk aminozuur staat. Schrijf de volgorde die staat voor de juiste amylase op. Dat is in jouw geval: Trp: UGG, Cys: UG (U of C), Ile: AU (U of C of A). Dus je weet al, dat de sequentie: UGG UG'X' AU'X' zal zijn. De vraag is nu nog wat in positie drie van het tweede en derde codon staat. Om dit op te lossen schrijf je ook op hoe de foute codon volgorde eruit kan zien. Hier moet je natuurlijk eerst weten welke drie aminozuren er nu WEL zijn. De twee sequenties leg je naast elkaar en je kijkt hoe deze uit elkaar kunnen zijn ontstaan (hierbij aan de verschillende soorten mutaties die mogelijk zijn denken: "punt" contra "shift" mutaties). Dat is een gepuzzel, maar je zou er wel uit moeten komen.