Het is niet mogelijk om een volledige lijst met pro- en contra argumenten over biotechnologie op te stellen. Deze argumenten hangen stek af van het desbetreffende onderwerp. Het argument, dat door biotechnologie nieuwe producten kunnen worden ontwikkeld is een heel sterk argument in de medische biotechnologie. Hier gaat het om ontwikkeling van nieuwe medicijnen tegen belangrijke ziekten. Maar het argument is minder krachtig als het om een nieuw voedingmiddel gaat. Voor de meeste mensen een nieuw medicijn wel belangrijk, een nieuw voedingmiddel niet of veel minder.
Sommige argumenten worden zowel door voor- als ook tegenstanders gebruikt, afhankelijk van het voorbeeld of de interpretatie. De volgende lijst is dan ook alles behalve volledig en kan slechts een beginpunt zijn om zelf na te denken.
Pro-argumenten BT:

ontwikkeling van geheel nieuwe producten

verbetering van kwaliteit producten

constantere kwaliteit producten

verhoging productiviteit en dus verlaging kostprijs product

additionele eigenschappen product

minder milieubelasting

minder energiegebruik

makkelijke = vlugge en betrouwbare kwaliteitscontrole

makkelijke = vlugge en betrouwbare detectie mogelijkheid
Contra-argumenten BT:

risico is niet te schatten

meer dierproeven

meer milieubelasting

niet nodig, doel kan ook met andere technieken bereikt worden

geen voordeel voor consument

versterking noord/zuid (arm/rijk) problematiek

te weinig aandacht voor vervolgproblemen

inbreuk in fundamenten van leven (ethiek)